Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80Y73 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80Y73 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q80Y73 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q80Y73 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q80Y73 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q80Y73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q80Y73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q80Y73 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q80Y73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q80Y73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q80Y73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q80Y73 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q80Y73 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q80Y73 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q80Y73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q80Y73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q80Y73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q80Y73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q80Y73 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q80Y73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q80Y73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q80Y73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q80Y73 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q80Y73 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q80Y73 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q80Y73 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q80Y73 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q80Y73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q80Y73 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q80Y73 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q80Y73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q80Y73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q80Y73 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q80Y73 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q80Y73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q80Y73 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q80Y73 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q80Y73 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q80Y73 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q80Y73 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q80Y73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q80Y73 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q80Y73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q80Y73 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q80Y73 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q80Y73 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q80Y73 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q80Y73 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q80Y73 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q80Y73 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q80Y73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q80Y73 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q80Y73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q80Y73 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q80Y73 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q80Y73 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q80Y73 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q80Y73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q80Y73 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q80Y73 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q80Y73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q80Y73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q80Y73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q80Y73 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms