Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc1Q80VQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc1Q80VQ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc1Q80VQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc1Q80VQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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