Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sestd1Q80UK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Sestd1Q80UK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sestd1Q80UK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sestd1Q80UK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sestd1Q80UK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms