Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf8Q80TJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf8Q80TJ7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf8Q80TJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf8Q80TJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Phf8Q80TJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf8Q80TJ7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms