Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lca5Q80ST9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lca5Q80ST9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lca5Q80ST9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lca5Q80ST9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lca5Q80ST9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms