Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSD4

Tbata, Protein TBATA, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbataQ7TSD4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TbataQ7TSD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TbataQ7TSD4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TbataQ7TSD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TbataQ7TSD4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TbataQ7TSD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TbataQ7TSD4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms