Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ckap2lQ7TS74 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap2lQ7TS74 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap2lQ7TS74 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap2lQ7TS74 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms