Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf250Q7TNU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf250Q7TNU6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Znf250Q7TNU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms