Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf1Q7TND5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpf1Q7TND5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpf1Q7TND5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf1Q7TND5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.6 ms