Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HhipQ7TN16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HhipQ7TN16 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HhipQ7TN16 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.8 ms