Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf139Q7TMV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf139Q7TMV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf139Q7TMV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf139Q7TMV1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms