Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17leQ7M764 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17leQ7M764 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17leQ7M764 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp17leQ7M764 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp17leQ7M764 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17leQ7M764 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp17leQ7M764 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms