Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mvb12aQ78HU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mvb12aQ78HU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mvb12aQ78HU3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mvb12aQ78HU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12aQ78HU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12aQ78HU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mvb12aQ78HU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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