Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RfflQ6ZQM0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RfflQ6ZQM0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RfflQ6ZQM0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RfflQ6ZQM0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RfflQ6ZQM0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms