Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nup188Q6ZQH8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nup188Q6ZQH8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nup188Q6ZQH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nup188Q6ZQH8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nup188Q6ZQH8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms