Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Topbp1Q6ZQF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Topbp1Q6ZQF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Topbp1Q6ZQF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Topbp1Q6ZQF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Topbp1Q6ZQF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Topbp1Q6ZQF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms