Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Igsf3Q6ZQA6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Igsf3Q6ZQA6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igsf3Q6ZQA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Igsf3Q6ZQA6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms