Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smpd4Q6ZPR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smpd4Q6ZPR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpd4Q6ZPR5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms