Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LcorQ6ZPI3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LcorQ6ZPI3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LcorQ6ZPI3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LcorQ6ZPI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms