Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atp2b4Q6Q477 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atp2b4Q6Q477 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b4Q6Q477 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp2b4Q6Q477 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b4Q6Q477 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms