Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cacna2d2Q6PHS9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms