Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx13Q6PHS6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx13Q6PHS6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx13Q6PHS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Snx13Q6PHS6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms