Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc57Q6PHN1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc57Q6PHN1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc57Q6PHN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms