Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk2Q6PGN3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclk2Q6PGN3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclk2Q6PGN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk2Q6PGN3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclk2Q6PGN3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms