Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sarm1Q6PDS3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sarm1Q6PDS3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Sarm1Q6PDS3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sarm1Q6PDS3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms