Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm2lQ6PDS0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vstm2lQ6PDS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms