Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim37Q6PCX9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim37Q6PCX9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim37Q6PCX9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim37Q6PCX9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim37Q6PCX9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim37Q6PCX9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim37Q6PCX9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim37Q6PCX9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim37Q6PCX9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms