Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gapvd1Q6PAR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gapvd1Q6PAR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Gapvd1Q6PAR5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gapvd1Q6PAR5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Gapvd1Q6PAR5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gapvd1Q6PAR5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms