Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BcrQ6PAJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BcrQ6PAJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BcrQ6PAJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BcrQ6PAJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcrQ6PAJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms