Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa4Q6P8K8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cpa4Q6P8K8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpa4Q6P8K8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpa4Q6P8K8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms