Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga2Q6P5E6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gga2Q6P5E6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gga2Q6P5E6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gga2Q6P5E6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga2Q6P5E6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms