Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casc4Q6P2L7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Casc4Q6P2L7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Casc4Q6P2L7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casc4Q6P2L7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms