Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gpbp1l1Q6NZP2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gpbp1l1Q6NZP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms