Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Szrd1Q6NXN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Szrd1Q6NXN1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Szrd1Q6NXN1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Szrd1Q6NXN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms