Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ltv1Q6NSQ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ltv1Q6NSQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ltv1Q6NSQ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ltv1Q6NSQ7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms