Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc66Q6NS45 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc66Q6NS45 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc66Q6NS45 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc66Q6NS45 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms