Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt77Q6IFZ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt77Q6IFZ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt77Q6IFZ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt77Q6IFZ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms