Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt39Q6IFX4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt39Q6IFX4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt39Q6IFX4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Krt39Q6IFX4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt39Q6IFX4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms