Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hist2h2aa1Q6GSS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hist2h2aa1Q6GSS7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms