Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Carmil1Q6EDY6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Carmil1Q6EDY6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Carmil1Q6EDY6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Carmil1Q6EDY6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Carmil1Q6EDY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Carmil1Q6EDY6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Carmil1Q6EDY6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Carmil1Q6EDY6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms