Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Smarca2Q6DIC0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Smarca2Q6DIC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Smarca2Q6DIC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Smarca2Q6DIC0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Smarca2Q6DIC0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Smarca2Q6DIC0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Smarca2Q6DIC0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms