Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp7Q6A4J8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp7Q6A4J8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp7Q6A4J8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp7Q6A4J8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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