Protein–RNA interactions for Protein: Q68ED3

Papd5, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd5Q68ED3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Papd5Q68ED3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Papd5Q68ED3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Papd5Q68ED3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Papd5Q68ED3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms