Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CbarpQ66L44 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CbarpQ66L44 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CbarpQ66L44 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CbarpQ66L44 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CbarpQ66L44 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms