Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tpgs2Q66JT5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tpgs2Q66JT5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpgs2Q66JT5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpgs2Q66JT5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms