Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VclQ64727 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VclQ64727 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VclQ64727 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VclQ64727 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VclQ64727 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VclQ64727 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VclQ64727 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VclQ64727 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VclQ64727 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VclQ64727 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VclQ64727 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VclQ64727 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VclQ64727 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VclQ64727 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VclQ64727 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VclQ64727 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VclQ64727 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VclQ64727 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VclQ64727 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VclQ64727 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VclQ64727 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VclQ64727 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VclQ64727 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VclQ64727 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VclQ64727 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VclQ64727 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VclQ64727 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VclQ64727 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VclQ64727 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VclQ64727 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VclQ64727 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VclQ64727 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VclQ64727 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VclQ64727 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VclQ64727 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VclQ64727 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VclQ64727 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VclQ64727 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VclQ64727 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VclQ64727 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VclQ64727 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VclQ64727 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VclQ64727 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VclQ64727 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VclQ64727 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VclQ64727 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VclQ64727 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VclQ64727 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VclQ64727 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VclQ64727 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VclQ64727 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VclQ64727 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VclQ64727 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VclQ64727 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VclQ64727 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VclQ64727 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VclQ64727 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VclQ64727 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VclQ64727 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VclQ64727 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VclQ64727 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VclQ64727 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VclQ64727 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VclQ64727 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms