Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx3Q64704 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx3Q64704 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx3Q64704 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx3Q64704 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms