Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gja3Q64448 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gja3Q64448 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gja3Q64448 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gja3Q64448 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gja3Q64448 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms