Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phc1Q64028 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phc1Q64028 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Phc1Q64028 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phc1Q64028 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms