Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itga3Q62470 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga3Q62470 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga3Q62470 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga3Q62470 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms